прадукты

Нядаўна мы паведамлялі, што пірэнавы нуклеатыд пераважна ўстаўляецца насупраць абазічнага сайта, 3'-Т дымера тыміну і большасці непашкоджаных асноў дражджавой ДНК-палімеразай eta (pol eta).Паколькі пірэн з'яўляецца непалярнай малекулай без здольнасці звязваць H-сувязі, незвычайна высокая эфектыўнасць увядзення dPMP прыпісваецца яго найвышэйшай здольнасці стэкінгу асноў і падкрэслівае важнасць стэкінгу асноў у выбары нуклеатыдаў па полі.Каб даследаваць ролю Н-сувязі і геаметрыі пары асноў у адборы нуклеатыдаў шляхам палявання, мы вызначылі эфектыўнасць увядзення мадыфікаваных падставай нуклеатыдаў 2,6-дыямінапурыну, 2-амінапурыну, 6-хлорпурыну і іназіну, якія б зрабіць розную колькасць Н-сувязяў з асновай шаблону ў залежнасці ад геаметрыі пары асноў.Спарванне падстаў Уотсана-Крыка, відаць, гуляе важную ролю ў выбары аналагаў нуклеатыдаў для ўстаўкі насупраць С і Т, пра што сведчыць зніжэнне адноснай эфектыўнасці ўстаўкі з памяншэннем колькасці Н-сувязяў Уотсана-Крыка і павелічэннем лік донар-донарных і акцэптар-акцэптарных узаемадзеянняў.Выбіральнасць нуклеатыднай устаўкі большая насупраць 5'-T, чым 3'-T дымера тыміну, у адпаведнасці з папярэдняй працай, якая сведчыць аб тым, што 5'-T утрымліваецца больш жорстка, чым 3'-T.Акрамя таго, устаўка A насупраць абодвух Ts дымера, відаць, апасродкавана спарваннем асноў Уотсана-Крыка, а не спарваннем асноў Хугсціна, зыходзячы з амаль аднолькавай эфектыўнасці ўвядзення A і 7-дэаза-A, у апошняй з якіх адсутнічае H- магчымасць склейвання на N7.Адносная эфектыўнасць увядзення нуклеатыдаў, якія могуць утвараць пары асноў Уотсана-Крыка, паралельная такой для фрагмента Кленава, у той час як фрагмент Кленава больш моцна адрознівае несупадзенні ў адпаведнасці з яго большай селектыўнасцю формы.Гэтыя вынікі падкрэсліваюць важнасць Н-сувязі і геаметрыі пар асноў Уотсана-Крыка ў адборы нуклеатыдаў як pol eta, так і фрагмента Клена, а таксама меншую ролю выбару формы пры ўстаўцы pol eta з-за яго больш адкрытай і меншай колькасці. абмежаваны актыўны сайт.